Ответ: Очень просто. В скрипте задайте столько функций сколько Вам нужно:
<script language="JavaScript">
<!--
function winop1()
{
windop = window.open("demo1.html","mywin","height=120,width=200,left=100,top=30");
}
function winop2()
{
windop = window.open("demo2.html","mywin1","height=120,width=200,left=100,top=30");
}
-->
</script>
И каждой ссылке задайте свою функцию
<a href="javascript:winop1();">Ссылка 1</a>
<a href="javascript:winop2();">Ссылка2</a> при клике по первой ссылке откроется доп. окно с файлом demo1.html, по второй с demo2.html. Параметры окон в каждой функции можно задавать разные(окна будут разные, такие как Вам нужно). Колличество функций как и колличество ссылок ,при клике по которам будут открываться окна, любое(сколько Вам нужно).
и 
